Linux (a jiný software)

Na Linux jsem přešel na podzim 2006 a již bych neměnil. Překvapilo mě, jak snadno jsem se s tím naučil a kolik možností nastavení naprosto všeho mám k dispozici. Nabídka software je úžasná, na Windows prostě nejsou k dispozici všechny potřebné aplikace v dostatečné kvalitě. Navíc si mohu vše nastavit podle sebe, vše je logické. A neprudí mě viry. :-)

Kurz práce s molekulárními daty v R 2017

Tagy: 

R je v současnosti asi nejmocnější nástroj na statistické výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu. Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2017

Tagy: 

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Mac OS X, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Základní znalost Linuxu není nutná. Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně na Mac OS X a dalších UNIXech. Znalosti práce v Linuxu/UNIXu se hodí např. při zpracování molekulárních a jiných dat. MetaCentrum je služba CESNETu poskytující přístup k obrovské výpočetní kapacitě. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

SUSE dort

Tagy: 

Jak udělat radost fanouškovi, uživateli a překladateli openSUSE? No přece správným dortem!

Prezentace o citačním software

Prezentace o citačním software v rámci bakalářského projektu bakalářského studia biologie. Prezentace částečně vychází ze starší prezentace na stejné téma od Michala Vinklera.

Kurz práce s molekulárními daty v R 2016

Tagy: 

R je v současnosti asi nejmocnější nástroj na statistické výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu. Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2016

Tagy: 

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Mac OS X, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Základní znalost Linuxu není nutná. Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně na Mac OS X a dalších UNIXech. Znalosti práce v Linuxu/UNIXu se hodí např. při zpracování molekulárních a jiných dat. MetaCentrum je služba CESNETu poskytující přístup k obrovské výpočetní kapacitě. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

Phylogenetic marker development for target enrichment from transcriptome and genome skim data: the pipeline and its application in southern African Oxalis (Oxalidaceae)

Phylogenetics benefits from using a large number of putatively independent nuclear loci and their combination with other sources of information, such as the plastid and mitochondrial genomes. To facilitate the selection of orthologous low-copy nuclear (LCN) loci for phylogenetics in non-model organisms, we created an automated and interactive script to select hundreds of LCN loci by a comparison between transcriptome and genome skim data. We used our script to obtain LCN genes for southern African Oxalis (Oxalidaceae), a speciose plant lineage in the Greater Cape Floristic Region.

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2015

Tagy: 

Od akademického roku 2015/16 je kurz v SISu jako MB120C17.

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Mac OS X, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Základní znalost Linuxu není nutná. Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně i na Mac OS X a dalších UNIXech. Kurz bude probíhat 26. a 27. ledna 2015 od 9:00 do cca 17:00 na Katedře botaniky PřF UK v Praze v praktiku OŽP (B13, 1. mezipatro, na konci chodby nalevo).

K dispozici je prezentace a data z proběhlého kurzu.

Stránky

Přihlásit se k odběru RSS - Linux (a jiný software) Přihlásit se k odběru Vojtěch Zeisek - All comments