Vojtěch Zeisek - Per aspera, Asparagus et Aspergillus ad A/astra. https://trapa.cz/cs cs Course of work with molecular data in R 2020 in České Budějovice https://trapa.cz/course-molecular-data-r-2020-cb <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden">Course of work with molecular data in R 2020 in České Budějovice</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p><a href="https://www.r-project.org/">R</a> is nowadays probably the most powerful tool for calculations of all kinds. There are plenty of modules available for work with molecular data. Those will be introduced during the course. The course will be taught from October 19<sup>th</sup> to Friday 23<sup>rd</sup> (see below). Details will be updated by the end of September.</p> <p>The course contains theory of used methods, tutorials with test data, tasks for individual work of participants, and more.</p></div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">Pá, 03/06/2020 - 22:39</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/fylogenetika" hreflang="cs">Fylogenetika</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/fylogeografie" hreflang="cs">Fylogeografie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/linux" hreflang="cs">Linux (a jiný software)</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/popgen" hreflang="cs">Populační genetika</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/prf-uk" hreflang="cs">Přírodovědecká fakulta UK</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/r" hreflang="cs">R</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/taxonomie" hreflang="cs">Taxonomie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/vyuka" hreflang="cs">Výuka</a></div> </div> </div> Fri, 06 Mar 2020 21:39:35 +0000 vojta 114 at https://trapa.cz Low genetic differentiation despite high fragmentation in the endemic serpentinophyte Minuartia smejkalii (M. verna agg., Caryophyllaceae) revealed by RADSeq SNP markers https://trapa.cz/minuartia-smejkalii <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden">Low genetic differentiation despite high fragmentation in the endemic serpentinophyte Minuartia smejkalii (M. verna agg., Caryophyllaceae) revealed by RADSeq SNP markers</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p><em>Minuartia smejkalii</em> is an obligate serpentinophyte plant endemic to the Czech Republic. Since the 1960s, the species’ habitat has undergone strong human-mediated fragmentation, resulting in extinction of some populations and dramatic size reduction of the remaining populations. Thus, contrary to the typically stable serpentine habitats, <em>M. smejkalii</em> habitats underwent a recent and severe decline, which can exacerbate the effects of fragmentation on population genetic structure. We examined the genetic structure of all known <em>M.</em></p></div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">Po, 01/13/2020 - 10:46</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/bu-av" hreflang="cs">Botanický ústav AV</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/fylogeografie" hreflang="cs">Fylogeografie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/popgen" hreflang="cs">Populační genetika</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/taxonomie" hreflang="cs">Taxonomie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/veda" hreflang="cs">Věda, výzkum, biologie</a></div> </div> </div> Mon, 13 Jan 2020 09:46:32 +0000 vojta 113 at https://trapa.cz PF 2020 https://trapa.cz/pf2020 <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden">PF 2020</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p>Pour féliciter 2020!</p> <p><img alt="PF 2020" data-entity-type="file" data-entity-uuid="b8b61283-749c-4447-bb70-0387d2455c67" src="/sites/default/files/inline-images/pf_2020_vjtz.jpg" class="align-center" /></p> </div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">Ne, 12/22/2019 - 14:54</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/ostatni" hreflang="cs">Ostatní</a></div> </div> </div> Sun, 22 Dec 2019 13:54:52 +0000 vojta 112 at https://trapa.cz HybSeq course 2020 https://trapa.cz/cs/hybseq-course-2020 <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden">HybSeq course 2020</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p>Intensive 4-days (5<sup>th</sup> day is not compulsory, but is open for any discussion, if there would be interest) course to learn all theory about HybSeq and practically learn how to analyze HybSeq data, how to solve all problems, and how to evaluate differences among gene trees. Important part is enough time to discuss everything, including practical problems and projects of individual participants.</p></div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">Čt, 12/19/2019 - 21:25</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/bioinformatika" hreflang="cs">Bioinformatika</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/hybseq" hreflang="cs">HybSeq</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/linux" hreflang="cs">Linux (a jiný software)</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/prf-uk" hreflang="cs">Přírodovědecká fakulta UK</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/veda" hreflang="cs">Věda, výzkum, biologie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/vyuka" hreflang="cs">Výuka</a></div> </div> </div> Thu, 19 Dec 2019 20:25:38 +0000 vojta 111 at https://trapa.cz Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2020 https://trapa.cz/cs/kurz-prikazove-radky-linuxu-2020 <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden">Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2020</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p>Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj umožňující efektivně zpracovat i velká data a zautomatizovat činnosti. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Apple osX, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Kurz je vhodný pro úplné začátečníky i mírně pokročilé. Jediným vstupním požadavkem je zájem (nebo potřeba) pracovat v příkazové řádce, typicky na linuxovém výpočetním serveru. Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně na osX a dalších UNIXových systémech.</p></div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">Po, 10/07/2019 - 16:56</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/linux" hreflang="cs">Linux (a jiný software)</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/opensuse" hreflang="cs">openSUSE</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/prf-uk" hreflang="cs">Přírodovědecká fakulta UK</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/vyuka" hreflang="cs">Výuka</a></div> </div> </div> Mon, 07 Oct 2019 14:56:22 +0000 vojta 109 at https://trapa.cz Kurz práce s molekulárními daty v R 2020 https://trapa.cz/cs/kurz-molekularni-data-r-2020 <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden"> Kurz práce s molekulárními daty v R 2020</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p><a href="https://www.r-project.org/">R</a> je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu.</p> <p>Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další.</p> <p>Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Nutná je alespoň minimální znalost molekulární biologie a vhodná je předchozí znalost alespoň některých metod analýz DNA dat.</p></div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">Po, 10/07/2019 - 16:28</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/fylogenetika" hreflang="cs">Fylogenetika</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/fylogeografie" hreflang="cs">Fylogeografie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/linux" hreflang="cs">Linux (a jiný software)</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/popgen" hreflang="cs">Populační genetika</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/prf-uk" hreflang="cs">Přírodovědecká fakulta UK</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/r" hreflang="cs">R</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/taxonomie" hreflang="cs">Taxonomie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/vyuka" hreflang="cs">Výuka</a></div> </div> </div> Mon, 07 Oct 2019 14:28:17 +0000 vojta 110 at https://trapa.cz Analysis of wild Taraxacum bicorne Dahlst. (Compositae–Crepidinae) as a potential alternative natural rubber crop https://trapa.cz/taraxacum-bicorne-natural-rubber <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden">Analysis of wild Taraxacum bicorne Dahlst. (Compositae–Crepidinae) as a potential alternative natural rubber crop</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p><em>Taraxacum koksaghyz</em> Rodin, a dandelion from the steppes of south-eastern Kazakhstan, has been known for long time as potential rubber producer, as a temperate region alternative to the tropical rubber tree <em>Hevea brasiliensis</em> Müll. Arg.. In this work, we evaluate <em>Taraxacum bicorne</em> Dahlst. (wild populations), a closely related congener of <em>T. koksaghyz</em>.</p></div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">St, 05/29/2019 - 14:36</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/bu-av" hreflang="cs">Botanický ústav AV</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/popgen" hreflang="cs">Populační genetika</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/taraxacum" hreflang="cs">Taraxacum</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/taxonomie" hreflang="cs">Taxonomie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/veda" hreflang="cs">Věda, výzkum, biologie</a></div> </div> </div> Wed, 29 May 2019 12:36:37 +0000 vojta 108 at https://trapa.cz Přednáška o skautské metodice pro KDF MFF https://trapa.cz/cs/skautska-metodika-kdf-mff <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden">Přednáška o skautské metodice pro KDF MFF</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p>Již řadu let každý rok přednáším jednu hodinu na semináři <a href="https://kdf.mff.cuni.cz/">Katedře didaktiky fyziky MFF UK</a> o skautské metodice. Začínáme stručnou historií a většina času je věnována skautské výchovné metodě, výchovnému programu a jeho tvorbě.</p> </div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">St, 04/03/2019 - 10:00</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/ekoodbor-junaka" hreflang="cs">Ekologický odbor Junáka</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/skauting" hreflang="cs">Skauting</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/vyuka" hreflang="cs">Výuka</a></div> </div> </div> Wed, 03 Apr 2019 08:00:07 +0000 vojta 107 at https://trapa.cz PF 2019 https://trapa.cz/pf2019 <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden">PF 2019</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p>Pour féliciter 2019!</p> <p><center><img src="/sites/default/obr/pf_2019_vjtz.jpg" /></center></p> </div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">St, 01/02/2019 - 22:04</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/ostatni" hreflang="cs">Ostatní</a></div> </div> </div> Wed, 02 Jan 2019 21:04:41 +0000 vojta 106 at https://trapa.cz Taxonomické principy, reprodukční systémy, populační genetika a vztahy mezi vybranými skupinami rodu Taraxacum (Asteraceae) https://trapa.cz/cs/taraxacum-taxon-evo <span class="field field--name-title field--type-string field--label-hidden">Taxonomické principy, reprodukční systémy, populační genetika a vztahy mezi vybranými skupinami rodu Taraxacum (Asteraceae)</span> <div class="clearfix text-formatted field field--name-body field--type-text-with-summary field--label-hidden field__item"><p>Rod Taraxacum (pampeliška, hvězdnicovité), mající ∼60 sekcí a 2 druhů, je známý pro své komplikované evoluční vztahy a taxonomii díky procesům jako je častá hybridizace, polyploidizace, nepohlavní rozmnožování, klonalita a nízká strukturální morfologická variabilita. Různé taxonomické koncepty a přístupy jsou v práci představeny, diskutovány a zhodnoceny z pohledu jejich schopnosti poradit si s tak komplikovaným rodem jako je Taraxacum. Různé procesy zodpovědné za tuto komplikovanou situaci v rámci pampelišek jsou diskutovány. Sekce Dioszegia, obsahující p. pozdní (T.</p></div> <span class="field field--name-uid field--type-entity-reference field--label-hidden"><span lang="" about="/cs/user/1" typeof="schema:Person" property="schema:name" datatype="">vojta</span></span> <span class="field field--name-created field--type-created field--label-hidden">St, 11/21/2018 - 16:55</span> <div class="field field--name-taxonomy-vocabulary-2 field--type-entity-reference field--label-inline clearfix"> <div class="field__label">Články</div> <div class="field__items"> <div class="field__item"><a href="/cs/bu-av" hreflang="cs">Botanický ústav AV</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/fylogenetika" hreflang="cs">Fylogenetika</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/fylogeografie" hreflang="cs">Fylogeografie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/popgen" hreflang="cs">Populační genetika</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/prf-uk" hreflang="cs">Přírodovědecká fakulta UK</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/taraxacum" hreflang="cs">Taraxacum</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/taxonomie" hreflang="cs">Taxonomie</a></div> <div class="field__item"><a href="/cs/veda" hreflang="cs">Věda, výzkum, biologie</a></div> </div> </div> Wed, 21 Nov 2018 15:55:02 +0000 vojta 104 at https://trapa.cz