Praktický kurz fylogenomických metod se zaměřením na NGS metodu Hyb-Seq. Metoda Hyb-Seq kombinuje cílené obohacení a tzv. mělké sekvenování genomu. V rámci kurzu budou probrány základy i nejnovějších poznatky v oblasti Hyb-Seq (návrh sond, laboratorní postup, analýza dat). Součástí kurzu je i práce s daty a jejich praktické analýzy různými přístupy, od primárních dat po konstrukci evolučních stromů koalescenčními a dalšími metodami. V laboratorní části kurzu budou připravovány a obohacovány NGS knihovny s využitím sonikátoru.
Kurz proběhne 10.-18. 6. 2024, viz https://botany.natur.cuni.cz/fer/hybseqcourse/
S aktualizovaným HybPiperem i doprovodnými skripty (mnou učená část).
- SIS: https://is.cuni.cz/studium/predmety/index.php?do=predmet&kod=MB120C117
- Materiály: https://botany.natur.cuni.cz/fer/hybseqcourse/
- Zdrojová data k mé části kurzu: https://github.com/V-Z/hybseq-course
