Structure is very popular software for revealing population structure. Here I describe easy workflow how to run independent runs of Structure in parallel to speed up whole process using statistical software R and how to facilitate use of CLUMPP and distruct with easy BASH scripts.
Arlequin is very popular tool for population genetics and in recent version (3.5) it has version running on Linux (arlecore, only computational core without GUI) as well as possibility to parse output using R statistical language. Those two features are described only briefly in official manual. I faced some issues when running Arlequin on Linux and parsing output using R. I'm describing here my solutions in case someone else would hava similar needs and problems.
Hodně lidí používá GMail (a naše fakulta dokonce přechází na Google Apps for Education) a zároveň je pro ně z různých důvodů pohodlnější používat Thunderbird (nebo jiné tzv. tlusté klienty - KMail, Evolution, Apple Mail, Outlook, ...). Ať už kvůli lepšímu zobrazení zpráv, různým doplňkům, potřebě mít maily stály u sebe, práci s více účty nebo prostě jen ze zvyku. Níže popíši nastavení svého Thunderbirdu tak, aby dobře spolupracoval se službami Google.
Pro Android existují minimálně desetitisíce aplikací a každou chvíli přibývají nové. Kdo se v tom má vyznat? Jak si vybrat tu pravou? Níže je seznam aplikací, které používám a mohu doporučit. Záleží na tom, co člověk potřebuje a co od aplikací vyžaduje. Samozřejmě lze vždy hledat na Marketu a fórech...
Znáte to. Když už musí linuxák pracovat na počítači s Windows (protože v okolí nic normálního není), nebo jste někde na cestách, ve veřejné knihovně, nějaké učebně... a potřebujete něco udělat na počítači. Ale ouha. Jediný dostupný počítač prakticky neobsahuje pořádný software a o bezpečnosti jeho prohlížeče by se dalo pochybovat... Co teď? Řešením může být PortableApps: USB flash disk s vlastními aplikacemi.
Oracle VirtualBox je velmi populární, jednoduchý a efektivní virtualizátor. Můžete tak mít spuštěn svůj oblíbený operační systém (Linux, samozřejmě;-) a v rámci něho vám poběží libovolný jiný operační systém. Ideální na testování všeho druhu nebo když potřebujete spustit nějakou aplikace, ktrerá ve vašem oblíbeném systému prostě neběží. Virtualizačních nástrojů je celá řada, já v následujícím textu stručně popíši instalaci Oracle VirtualBoxu 3.2 na openSUSE 11.3. Na ostatních (Linuxových) systémech to bude velmi podobné.
Mozilla Firefox je sám o sobě špičkový prohlížeč. Ale nebyl by tak úspěšný kdyby k němu nebylo k dispozici tisíce doplňků, díky kterým si jej každý může přizpůsobit svým představám. Jejich nastavení najdete v nabídce Nástroje | Správce doplňků Na druhou stranu jejich potenciálu většina lidí nevyužívá, což je velká škoda.
Z nějakého důvodu za mnou často chodí lidé, abych jim pomohl s tím či oným počítačovým problémem. Když se srovnám s kamarády informatiky, vím, že nic nevím a neumím, ale co potřebuji, tak většinou nějak zvládnu. Navíc se na katedře starám a web a webový a FTP server (samozřejmě běžící na Linuxu). K mé nelibosti k tomu přibyl i server běžící na MS Windows 2008, ale ten naštěstí slouží jenom jako skladiště dat, takže s ním není moc práce. O doménu (přihlašování) se stará CIT. O k tomu připojené počítače se starat nemíním a pokud se nikdo nenajde, půjde to s nimi po čase z kopce...
