Přejít k hlavnímu obsahu
Domů
Vojtěch Zeisek

Hlavní navigace

  • Domů
  • Articles
  • Fotogalerie
  • CV
  • Kontakt
Nástroje
  • Hledat
  • Archiv
  • Slovník
  • Nový obsah
  • Cookie settings

Drobečková navigace

  1. Domů

Populační genetika

By vojta, 12 Říjen, 2022

Kurz práce s molekulárními daty v R 2023

R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Jejich reprezentativní výběr je náplní kurzu.

Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další. Cílem je naučit studenty analýzu molekulárních dat v programovacím jazyce R, představit dostupné balíčky pro jejich analýzu a praktické vyzkoušení si analýz vlastních nebo poskytnutých dat.

Články
Fylogenetika
Fylogeografie
Linux (a jiný software)
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
R
Taxonomie
Výuka
By vojta, 12 Říjen, 2022

The importance of considering the evolutionary history of polyploids when assessing climatic niche evolution

Although whole-genome duplication (WGD) is an important speciation force, we still lack a consensus on the role of niche differentiation in polyploid evolution. In addition, the role of genome doubling per se vs. later divergence on polyploid niche evolution remains obscure. One reason for this might be that the intraspecific genetic structure of polyploid complexes and interploidy gene flow is often neglected in ecological studies. Here, we aim to investigate to which extent these evolutionary processes impact our inference on niche differentiation of autopolyploids.

Články
Arabidopsis a Brassicaceae
Bioinformatika
Botanický ústav AV
Fylogeografie
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
Věda, výzkum, biologie
By vojta, 11 Listopad, 2021

Kurz práce s molekulárními daty v R 2022

R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Jejich reprezentativní výběr je náplní kurzu.

Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další. Cílem je naučit studenty analýzu molekulárních dat v programovacím jazyce R, představit dostupné balíčky pro jejich analýzu a praktické vyzkoušení si analýz vlastních nebo poskytnutých dat.

Články
Fylogenetika
Fylogeografie
Linux (a jiný software)
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
R
Taxonomie
Výuka
By vojta, 25 Únor, 2021

STRUCTURE multi PBS Pro scripts

Set of scripts to run STRUCTURE in parallel on computing grids like MetaCentrum. Scripts are designed for grids and clusters using PBS Pro, but can be easily adopted for another queue system.

Články
Bioinformatika
Botanický ústav AV
Fylogenetika
Fylogeografie
Linux (a jiný software)
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
Taxonomie
Věda, výzkum, biologie
By vojta, 29 Prosinec, 2020

Parallel Alpine Differentiation in Arabidopsis arenosa

Parallel evolution provides powerful natural experiments for studying repeatability of evolution and genomic basis of adaptation. Well-documented examples from plants are, however, still rare, as are inquiries of mechanisms driving convergence in some traits while divergence in others. Arabidopsis arenosa, a predominantly foothill species with scattered morphologically distinct alpine occurrences is a promising candidate. Yet, the hypothesis of parallelism remained untested.

Články
Arabidopsis a Brassicaceae
Bioinformatika
Botanický ústav AV
Fylogenetika
Populační genetika
Věda, výzkum, biologie
By vojta, 6 Říjen, 2020

Kurz práce s molekulárními daty v R 2021

R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu.

Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další.

Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Nutná je alespoň minimální znalost molekulární biologie a vhodná je předchozí znalost alespoň některých metod analýz DNA dat.

Články
Fylogenetika
Fylogeografie
Linux (a jiný software)
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
R
Taxonomie
Výuka
By vojta, 6 Březen, 2020

Course of work with molecular data in R 2020 in České Budějovice

R is nowadays probably the most powerful tool for calculations of all kinds. There are plenty of modules available for work with molecular data. Those will be introduced during the course. The course will be taught from October 19th to Friday 23rd (see below). The course will be exclusively on-line, there will be no personal meeting.

Články
Fylogenetika
Fylogeografie
Linux (a jiný software)
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
R
Taxonomie
Výuka
By vojta, 13 Leden, 2020

Low genetic differentiation despite high fragmentation in the endemic serpentinophyte Minuartia smejkalii (M. verna agg., Caryophyllaceae) revealed by RADSeq SNP markers

Minuartia smejkalii is an obligate serpentinophyte plant endemic to the Czech Republic. Since the 1960s, the species’ habitat has undergone strong human-mediated fragmentation, resulting in extinction of some populations and dramatic size reduction of the remaining populations. Thus, contrary to the typically stable serpentine habitats, M. smejkalii habitats underwent a recent and severe decline, which can exacerbate the effects of fragmentation on population genetic structure. We examined the genetic structure of all known M.

Články
Botanický ústav AV
Fylogeografie
Populační genetika
Taxonomie
Věda, výzkum, biologie
By vojta, 7 Říjen, 2019

Kurz práce s molekulárními daty v R 2020

R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu.

Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další.

Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Nutná je alespoň minimální znalost molekulární biologie a vhodná je předchozí znalost alespoň některých metod analýz DNA dat.

Články
Fylogenetika
Fylogeografie
Linux (a jiný software)
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
R
Taxonomie
Výuka
By vojta, 29 Květen, 2019

Analysis of wild Taraxacum bicorne Dahlst. (Compositae–Crepidinae) as a potential alternative natural rubber crop

Taraxacum koksaghyz Rodin, a dandelion from the steppes of south-eastern Kazakhstan, has been known for long time as potential rubber producer, as a temperate region alternative to the tropical rubber tree Hevea brasiliensis Müll. Arg.. In this work, we evaluate Taraxacum bicorne Dahlst. (wild populations), a closely related congener of T. koksaghyz.

Články
Botanický ústav AV
Populační genetika
Taraxacum
Taxonomie
Věda, výzkum, biologie

Pagination

  • 1
  • Následující stránka
Populační genetika
  • Czech Czech
  • English English

Proč používat Linux
openSUSE.org
Průvodce Linuxem
KDE - K Desktop Environment
openSUSE GNU/Linux

ORCID iD iconhttps://orcid.org/0000-0003-3481-9367

ResearchID/Publons

GitHub Logo, https://github.com/V-Z

Hlavní RSS kanál a mapa stránek s přehledem kanálů.

Menu uživatelského účtu

  • Přihlásit se

Licence Creative Commons
Dílo dílo, jehož autorem je Vojtěch Zeisek, podléhá licenci Creative Commons Uveďte původ-Neužívejte komerčně-Nezpracovávejte 4.0 Mezinárodní.

Patička

  • Kontakt
  • Soukromí na tomto webu
Powered by Drupal