Přejít k hlavnímu obsahu
Domů
Vojtěch Zeisek

Hlavní navigace

  • Domů
  • Articles
  • Fotogalerie
  • CV
  • Kontakt
Nástroje
  • Hledat
  • Archiv
  • Slovník

Drobečková navigace

  1. Domů

Linux (a jiný software)

Od vojta , 9 Září, 2024

Kurz práce s molekulárními daty v R 2025

R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Jejich reprezentativní výběr je náplní kurzu.

Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další. Cílem je naučit studenty analýzu molekulárních dat v programovacím jazyce R, představit dostupné balíčky pro jejich analýzu a praktické vyzkoušení si analýz vlastních nebo poskytnutých dat.

Články
Fylogenetika
Fylogeografie
Linux (a jiný software)
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
R
Taxonomie
Výuka
Od vojta , 9 Září, 2024

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2025

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj umožňující efektivně zpracovat i velká data a zautomatizovat činnosti. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Apple macOS, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Kurz je vhodný pro úplné začátečníky i mírně pokročilé. Jediným vstupním požadavkem je zájem (nebo potřeba) pracovat v příkazové řádce, typicky na linuxovém výpočetním serveru.

Články
Linux (a jiný software)
openSUSE
Přírodovědecká fakulta UK
Výuka
Od vojta , 13 Květen, 2024

Target enrichment v systematice aneb HybSeq kurz 2024

Praktický kurz fylogenomických metod se zaměřením na NGS metodu Hyb-Seq. Metoda Hyb-Seq kombinuje cílené obohacení a tzv. mělké sekvenování genomu. V rámci kurzu budou probrány základy i nejnovějších poznatky v oblasti Hyb-Seq (návrh sond, laboratorní postup, analýza dat). Součástí kurzu je i práce s daty a jejich praktické analýzy různými přístupy, od primárních dat po konstrukci evolučních stromů koalescenčními a dalšími metodami. V laboratorní části kurzu budou připravovány a obohacovány NGS knihovny s využitím sonikátoru.

Články
Bioinformatika
Fylogenetika
HybSeq
Linux (a jiný software)
Přírodovědecká fakulta UK
Věda, výzkum, biologie
Výuka
Od vojta , 27 Září, 2023

Kurz práce s molekulárními daty v R 2024

R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Jejich reprezentativní výběr je náplní kurzu.

Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další. Cílem je naučit studenty analýzu molekulárních dat v programovacím jazyce R, představit dostupné balíčky pro jejich analýzu a praktické vyzkoušení si analýz vlastních nebo poskytnutých dat.

Články
Fylogenetika
Fylogeografie
Linux (a jiný software)
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
R
Taxonomie
Výuka
Od vojta , 27 Září, 2023

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2024

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj umožňující efektivně zpracovat i velká data a zautomatizovat činnosti. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Apple macOS, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Kurz je vhodný pro úplné začátečníky i mírně pokročilé. Jediným vstupním požadavkem je zájem (nebo potřeba) pracovat v příkazové řádce, typicky na linuxovém výpočetním serveru.

Články
Linux (a jiný software)
openSUSE
Přírodovědecká fakulta UK
Výuka
Od vojta , 29 Květen, 2023

Target enrichment v systematice aneb HybSeq kurz 2023

Praktický kurz fylogenomických metod se zaměřením na NGS metodu Hyb-Seq. Metoda Hyb-Seq kombinuje cílené obohacení a tzv. mělké sekvenování genomu. V rámci kurzu budou probrány základy i nejnovějších poznatky v oblasti Hyb-Seq (návrh sond, laboratorní postup, analýza dat). Součástí kurzu je i práce s daty a jejich praktické analýzy různými přístupy, od primárních dat po konstrukci evolučních stromů koalescenčními a dalšími metodami. V laboratorní části kurzu budou připravovány a obohacovány NGS knihovny s využitím sonikátoru.

Články
Bioinformatika
Fylogenetika
HybSeq
Linux (a jiný software)
Přírodovědecká fakulta UK
Věda, výzkum, biologie
Výuka
Od vojta , 12 Říjen, 2022

Kurz práce s molekulárními daty v R 2023

R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Jejich reprezentativní výběr je náplní kurzu.

Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další. Cílem je naučit studenty analýzu molekulárních dat v programovacím jazyce R, představit dostupné balíčky pro jejich analýzu a praktické vyzkoušení si analýz vlastních nebo poskytnutých dat.

Články
Fylogenetika
Fylogeografie
Linux (a jiný software)
Populační genetika
Přírodovědecká fakulta UK
R
Taxonomie
Výuka
Od vojta , 12 Říjen, 2022

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2023

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj umožňující efektivně zpracovat i velká data a zautomatizovat činnosti. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Apple macOS, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Kurz je vhodný pro úplné začátečníky i mírně pokročilé. Jediným vstupním požadavkem je zájem (nebo potřeba) pracovat v příkazové řádce, typicky na linuxovém výpočetním serveru.

Články
Linux (a jiný software)
openSUSE
Přírodovědecká fakulta UK
Výuka
Od vojta , 3 Červen, 2022

Target enrichment v rostlinné systematice aneb HybSeq kurz 2022

Praktický kurz fylogenomických metod se zaměřením na NGS metodu Hyb-Seq. Metoda Hyb-Seq kombinuje cílené obohacení a tzv. mělké sekvenování genomu. V rámci kurzu budou probrány základy i nejnovějších poznatky v oblasti Hyb-Seq (návrh sond, laboratorní postup, analýza dat). Součástí kurzu je i práce s daty a jejich praktické analýzy různými přístupy, od primárních dat po konstrukci evolučních stromů koalescenčními a dalšími metodami. V laboratorní části kurzu budou připravovány a obohacovány NGS knihovny s využitím sonikátoru.

Články
Bioinformatika
Fylogenetika
HybSeq
Linux (a jiný software)
Přírodovědecká fakulta UK
Věda, výzkum, biologie
Výuka
Od vojta , 11 Leden, 2022

Virtual machine for my courses

For my courses ofwork in Linux command line not only for MetaCentrum and with molecular data in R I provide VirtualBox image, which allows to run complete desktop Linux (in this case openSUSE Leap) with all preinstalled applications needed for both courses. It's easy way how to get fully working Linux to play with. It requires at least bit powerful notebook, e.g. at least quad-core with at least 8 GB RAM, but more is better.

Články
Bioinformatika
Linux (a jiný software)
openSUSE
Přírodovědecká fakulta UK
Výuka

Pagination

  • 1
  • Následující stránka
Linux (a jiný software)
  • Czech Czech
  • English English

Proč používat Linux

openSUSE.org

Průvodce Linuxem

KDE - K Desktop Environment

openSUSE GNU/Linux

ORCID iD iconhttps://orcid.org/0000-0003-3481-9367

ResearchID/Publons

GitHub Logo, https://github.com/V-Z

Hlavní RSS kanál a mapa stránek s přehledem kanálů.

Menu uživatelského účtu

  • Přihlásit se

Licence Creative Commons

Dílo dílo, jehož autorem je Vojtěch Zeisek, podléhá licenci Creative Commons Uveďte původ-Neužívejte komerčně-Nezpracovávejte 4.0 Mezinárodní.

Patička

  • Kontakt
  • Soukromí na tomto webu
Powered by Drupal