Linux (a jiný software)

Course of work with molecular data in R 2020 in České Budějovice

Napsal uživatel vojta dne Pá, 03/06/2020 - 22:39

R is nowadays probably the most powerful tool for calculations of all kinds. There are plenty of modules available for work with molecular data. Those will be introduced during the course. The course will be taught from October 19th to Friday 23rd (see below). Details will be updated by the end of September.

The course contains theory of used methods, tutorials with test data, tasks for individual work of participants, and more.

HybSeq course 2020

Napsal uživatel vojta dne Čt, 12/19/2019 - 21:25

Intensive 4-days (5th day is not compulsory, but is open for any discussion, if there would be interest) course to learn all theory about HybSeq and practically learn how to analyze HybSeq data, how to solve all problems, and how to evaluate differences among gene trees. Important part is enough time to discuss everything, including practical problems and projects of individual participants.

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2020

Napsal uživatel vojta dne Po, 10/07/2019 - 16:56

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj umožňující efektivně zpracovat i velká data a zautomatizovat činnosti. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Apple osX, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Kurz je vhodný pro úplné začátečníky i mírně pokročilé. Jediným vstupním požadavkem je zájem (nebo potřeba) pracovat v příkazové řádce, typicky na linuxovém výpočetním serveru. Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně na osX a dalších UNIXových systémech.

Kurz práce s molekulárními daty v R 2020

Napsal uživatel vojta dne Po, 10/07/2019 - 16:28

R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu.

Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další.

Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Nutná je alespoň minimální znalost molekulární biologie a vhodná je předchozí znalost alespoň některých metod analýz DNA dat.

Kurz práce s molekulárními daty v R 2019

Napsal uživatel vojta dne So, 10/06/2018 - 17:18

R je v současnosti asi nejmocnější nástroj na statistické výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu. Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2019

Napsal uživatel vojta dne So, 10/06/2018 - 17:04

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Apple osX, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Základní znalost Linuxu není nutná. Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně na osX a dalších UNIXech. Znalosti práce v Linuxu/UNIXu se hodí např. při zpracování molekulárních a jiných dat. MetaCentrum je služba CESNETu poskytující přístup k obrovské výpočetní kapacitě. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2018

Napsal uživatel vojta dne St, 10/04/2017 - 12:46

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Mac OS X, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Základní znalost Linuxu není nutná. Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně na Mac OS X a dalších UNIXech. Znalosti práce v Linuxu/UNIXu se hodí např. při zpracování molekulárních a jiných dat. MetaCentrum je služba CESNETu poskytující přístup k obrovské výpočetní kapacitě. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

Kurz práce s molekulárními daty v R 2018

Napsal uživatel vojta dne St, 10/04/2017 - 11:00

R je v současnosti asi nejmocnější nástroj na statistické výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu. Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

Tento ročník je kurz o den rozšířen, prodloužen na 4 dny, a bude ohodnocen 2 kredity.

Překládání openSUSE na LinuxDays 2017

Z iniciativy Hodyho proběhne na LinuxDays 2017 (asi největší, již tradiční, české setkání, příznivců, uživatelů a vývojářů Linuxu a dalších moderních otevřených technologií) lokalizační odpoledne. Kromě openSUSE se na něm představí i GNOME, Mozilla a The Document Foundation (LibreOffice).

vojta Po, 10/02/2017 - 22:31

Kurz práce s molekulárními daty v R 2017

Napsal uživatel vojta dne Út, 10/11/2016 - 14:38

R je v současnosti asi nejmocnější nástroj na statistické výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu. Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.