R

Statistický jazyk <a href="http://www.r-project.org/" type="text/html" rel="nofollow">R</a>

Kurz práce s molekulárními daty v R 2018

Tagy: 

R je v současnosti asi nejmocnější nástroj na statistické výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu. Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.
Tento ročník je kurz o den rozšířen, prodloužen na 4 dny, a bude ohodnocen 2 kredity.

Kurz práce s molekulárními daty v R 2017

Tagy: 

R je v současnosti asi nejmocnější nástroj na statistické výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu. Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

Kurz práce s molekulárními daty v R 2016

Tagy: 

R je v současnosti asi nejmocnější nástroj na statistické výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu. Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

Kurz práce s molekulárními daty v R 2015

Tagy: 

Od akademického roku 2015/16 je kurz v SISu jako MB120C16.

R je v současnosti asi nejmocnější nástroj na statistické výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu. Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Kurz bude probíhat od 14. do 16. ledna 2015 od 9:00 do cca 17:00 na Katedře botaniky PřF UK v Praze v Krajinově posluchárně (B14, 2. mezipatro na konci chodby; středa a čtvrtek) a v posluchárně OŽP (B12, 1. mezipatro na konci chodby napravo; pátek).

K dispozici je prezentace a data z proběhlého kurzu.

Structure, R and Linux

Tagy: 

Structure is very popular software for revealing population structure. Here I describe easy workflow how to run independent runs of Structure in parallel to speed up whole process using statistical software R and how to facilitate use of CLUMPP and distruct with easy BASH scripts. Of course, we work on Linux (although another UNIX systems like Mac OS X will be very similar).

Arlequin and R under Linux

Tagy: 

Arlequin is very popular tool for population genetics and in recent version (3.5) it has version running on Linux (arlecore, only computational core without GUI) as well as possibility to parse output using R statistical language. Those two features are described only briefly in official manual. I faced some issues when running Arlequin on Linux and parsing output using R.

Články pro linuxové weby

Aktualizovaný seznam mých článků souvisejících s Linuxem, které vyšly povětšinou na LinuxEXPRESu, méně i na jinách webech.

Vyřešené příklady z biostatistiky v R

Tady jsou příklady ze Základů biostatistiky prof. Herbena, které jsem (vy)řešil v R. Kromě posledního příkladu jsem si tím celkem jist (pro něj bych uvítal nějakou dobrou radu:-).
Původně jsem měl tendenci napsat i obecný návod (základy práce v R), ale nějak jsem se k tomu nedokopal... Krom toho už se to snad bere na přednášce. Rád bych jen připomenul linuxový program Rkward (grafická nadstavba nad R) a doplněk do OpenOffice.org R4CalcAž budu mít čas a energii, rád bych v R udělal vzorová řešení i příkladů z biostatistiky II (Canoco) a z Fenetiky a kladistiky I.

Stránky

Přihlásit se k odběru RSS - R Přihlásit se k odběru Vojtěch Zeisek - All comments