R

Arlequin and R under Linux

Napsal uživatel vojta dne Út, 07/01/2014 - 12:42

Arlequin is very popular tool for population genetics and in recent version (3.5) it has version running on Linux (arlecore, only computational core without GUI) as well as possibility to parse output using R statistical language. Those two features are described only briefly in official manual. I faced some issues when running Arlequin on Linux and parsing output using R. I'm describing here my solutions in case someone else would hava similar needs and problems.

Vyřešené příklady z biostatistiky v R

Napsal uživatel vojta dne Út, 01/27/2009 - 00:26

Tady jsou příklady ze Základů biostatistiky prof. Herbena, které jsem (vy)řešil v R. Kromě posledního příkladu jsem si tím celkem jist (pro něj bych uvítal nějakou dobrou radu:-). Původně jsem měl tendenci napsat i obecný návod (základy práce v R), ale nějak jsem se k tomu nedokopal... Krom toho už se to snad bere na přednášce.

Vylepšení OpenOffice

Napsal uživatel vojta dne Pá, 01/16/2009 - 15:31

OpenOffice.org je rozšířený kancelářský balík, který statně konkuruje MS Office. Relativně málo lidí však ví, že si jeho funkcionalitu může rozšířit pomocí tzv. doplňků. V libovolném programu ze sady OpenOffice vstupte do menu Nástroje a vyberte položku Správce rozšíření. Menu Nástroje Objeví se okno Správce rozšíření, pomocí kterého můžete vaše doplnky spravovat. Tlačítkem Přidat přidáte doplněk, který jste si již před tím uložili do počítače (v podobě např.

Biologický software pro Linux

Napsal uživatel vojta dne St, 11/19/2008 - 01:13

Před časem mě Marek Stopka s Robertem Krátkým požádali o sepsání článku, který by nastiňoval možnosti využití Linuxu v biologii. Nemůžu se považovat za velkého odborníka, neboť nepotřebuji velké množství speciálního software, ale pro základní orientaci a představu o možnostech svobodného software na poli vědy to snad stačí.