Structure is very popular software for revealing population structure. Here I describe easy workflow how to run independent runs of Structure in parallel to speed up whole process using statistical software R and how to facilitate use of CLUMPP and distruct with easy BASH scripts.
Arlequin is very popular tool for population genetics and in recent version (3.5) it has version running on Linux (arlecore, only computational core without GUI) as well as possibility to parse output using R statistical language. Those two features are described only briefly in official manual. I faced some issues when running Arlequin on Linux and parsing output using R. I'm describing here my solutions in case someone else would hava similar needs and problems.
Již nějakou dobu každý rok přednáším jednu hodinu na semináři Katedře didaktiky fyziky MFF UK o skautské metodice. V minulých letech jsem mluvil hlavně o tvorbě nového výchovného programu. Jaký byl výchozí stav, proč jej bylo nutné změnit, jak celý proces vypadal a jaký je výsledek. Teď jsem se zaměřil více na metodiku jako takovou (aniž by předchozí téma zmizelo) a přidal jsem i špetku historie a myšlenkových základů.
Severní Andy jsou prostorem nebetyčných hor vytvářejících izolovaná údolí a ostrovní vrcholky a tak není divu, že to je jedna z přírodovědně nejbohatších a nejhodnotnějších oblastí na světě. Hory jsou navíc oproti pralesům jen velmi málo probádané a tak tam o zajímavé nálezy není nouze. Expedice do And jsou obtížné, ale rozhodně stojí za to. Na pár kilometrech můžete vystoupat z vlhkých pralesů až do ledovcové pustiny. A nelze zapomínat ani na zajímavé místní kultury, které neprávem stojí trochu ve stínu tamní přírody a kultur předkolumbovského Peru.
Čeští botanici se poslední dobou činili a připsali si na konto další sérii významných objevů, o kterých referoval prestižní impaktový žurnál Botany.cz.
Nedávné prezidentské volby jsou katastrofa. Místo naprosto příšerného prezidenta budeme mít přinejlepším strašného prezidenta. Prezidenta, který lže jako když Rudé právo tiskne. Prezidenta, který bezostyšně rozdmýchává nejodpornější nacionalistické vášně. Prezidenta, který často nemá na věcnou argumentaci, a tak se snižuje k odporným osobním útokům. Prezidenta, který je hulvát a oplzlý ožrala. Prezidenta, který má potenciál nadělat nám ze všech sousedů nepřátele. A tak by šlo pokračovat ještě dlouho.
Učená společnost České republiky sdružuje řadu českých vědců a klade si za cíl šířit osvětu, vzdělání a zájem o vědu a být fórem, kde vědci mohou diskutovat aktuální problémy související např s financováním. Před nadcházející prezidentskou volbou vydala Prosbu k mladým, kterou apeluje na uváženou volbu.
S názory Václava Klause se, mírně řečeno, neztotožňuji. V podstatě si jej vůbec nevážím, neuznávám ho jako svého prezidenta a těším se, až navždy skončí na hnojišti dějin. Narazil jsem na hezkou věc, která odpočítává, kdy aspoň přestane být prezidentem.